南竿下腰山營區位於連江縣南竿鄉清水村文化路、勝利水庫上方、勝利坑道的對面,原屬陸軍馬祖防衛指揮部工兵營的營部區域,2007年由中國科技大學主持之《96年度連江縣文化景觀普査計畫》調查時, 營區面積8684平方公尺,建物共18個,工事數量4個。
下腰山營區設施保留完整,建築似碉堡、司令部,擁有臥室、廚房、廁所、集合場等設施,清楚呈現軍方營區的特色。南竿下腰山營區皆已無軍隊駐守,現今一半的房舍已分發給海洋委員會海巡署金馬澎分署馬祖岸巡隊使用。
下腰山營區屬於第二線核心陣地。馬祖的軍事設施基本上有海岸防衛設施、軍營、地下坑道、崗哨、軍事用途民用設施,空間上可分為「第一線戰鬥陣地」及「第二線核心陣地」。第二線核心陣地分為高地的觀測所,以及通常建立於地形隱蔽位置的營區、砲陣地、戰備區域與訓練基地等;核心據點為各島的總指揮部,通常設置於制高點,並於內部開挖樹狀通道,防禦力高且能掌握最多資訊。
2022年10月《連江縣文化資產資料數位整合建置更新維護與優化計畫》現地調查,基地設施被雜草所掩埋。