廟址位於連江縣南竿鄉馬祖村52號。主祀神明白馬文大王、白馬武大王,龍邊左神龕奉祀天上聖母與順天聖母,虎邊右神龕奉祀福德正神。屬於規模較小的廟宇,所屬社友信徒也都與同村大廟媽祖境天后宮的部分社友重疊,所以只能舉辦小型擺暝祭典,不辦理遶境及食福活動。不過有同村之誼的馬祖境天后宮在舉辦清潔衢道及遶境時,亦會行經科蹄澳白馬文武大王廟,充分顯示出村莊大廟之風範。
每逢元宵擺暝祭典為馬祖四鄉五島的年度盛事,依據《106年連江縣擺暝民俗調查研究案成果報告書》於2017、2018年現地訪調整理,其擺暝祭典於農曆正月十五日舉行,自晚上5點開始,參加擺暝祭祀之成員大都為該宮所屬之社友,並由本地社友8人輪值「福首」,每年輪值2人,每4年為1輪,福首須各準備1份供品於廟內擺暝獻祭,而廟管會也會準備一隻神豬共同參與擺暝祭典,至農曆正月十六日早晨才撤饌。不辦理送喜至喜家儀式,而是由喜家準備豬肉、太平蛋、橘子等供品詣廟報喜,祭拜完後廟方留存一半神豬,另一半神豬則由喜家帶回食福納祥。