馬祖酒廠以生產老酒起家，全盛時期，除了南竿本廠，還在北竿、東莒設立分廠，年產37萬多公升，後來因為市場銷售不佳，86年開始停產。 國軍進駐前，馬祖民眾自行釀造老酒，戰地政務實施後，依據公賣條例，不准民間生產，馬祖酒廠【原為中興酒廠】便開始釀造老酒，以應民間需要。民國50年，酒廠擴大營業規模，設立北竿分廠，65年再增加東莒分廠，兩個分廠全部生產老酒，且以銷售當地軍民為主，這時候也是老酒生產全盛時期。 早年由於釀造老酒設備不足，老酒容易變質發酸，70年購置半自動蒸氣鍋爐，經過高溫殺菌和過濾，老酒品質大幅提升，不過限於經費，只有南竿本廠設置，北竿和東莒出品的老酒依然發酸，71年分廠歸併本廠，畫下句點。 老酒出產以來，一直無法打開國內市場，其中原因很多，例如缺乏行銷策略以及老酒略帶酸味，台灣民眾不太能夠接受等，再者地區民眾不斷遷居台灣，老酒市場萎縮在所難免。 現今馬祖開放觀光，酒廠看好未來市場，106年又開始生產老酒。很顯然，馬祖老酒是不會缺少的。