戰地政務實施後，政府對於公教員工福利十分重視，不過要求工作更為嚴格。權利與義務原本就分不開，只是位處前線，比較特別。 戰地政務初期，政府對公務人員要求，幾乎和國軍部隊相同。以政委會為例，員工除非已經結婚，否則必須住在機關，如果外宿，得填表或報名長官，以便掌握行動。其次軍政長官任務在身，員工隨叫隨到，等於２４小時執勤。上班穿著制服並且嚴守保密規定。 福利方面，地區所有公教員工薪餉，增加戰地加給一項，是薪俸的三分之一，有些單位還有房屋修繕補助，也有年節福利金。制服由政府統一製作，免費提供，但要依照規定穿著，特別是高級長官蒞臨，服裝整齊是必要的。更重要的是，馬祖一旦發生戰事，政府提供公教員工相關設施，安全較有保障。 儘管福利優於台灣公務人員，但是馬祖是戰地，安全受到威脅，生活條件更差，很少人願意前來工作，特別是義務役戰士，說到馬祖服役心生恐懼。好在這些特別的權利和義務，陸續修正，漫漫恢復常態。